Mit The Timebuilders: Pyramid Rising II wird ein neues, spannendes Kapitel der 18. ägyptischen Dynastie eingeläutet. Hapu, dem sympathischen Hofpriester von Pharao Touti, fällt ein antiker Papyrus in die Hände, in dem die Zerstörung Ägyptens vorausgesagt wird. Dies kann nur verhindert werden, indem innerhalb von vier Monden acht Tempel zu Ehren der Götter errichtet werden. Als wäre dies allein nicht schon genug Anlass zur Sorge, wird der königliche Architekt Senmout von einer mysteriösen Krankheit heimgesucht, die es ihm unmöglich macht, das Projekt zu leiten. Und so übernimmt der Spieler die Rolle des Baumeisters und koordiniert die Errichtung der gigantischen Tempelanlage.